Stengingen skjer i lys av den nær forestående internasjonale uttrekkingen av militært personell fra Afghanistan, opplyste han tirsdag.
Det er økende frykt for hvordan sikkerhetssituasjonen i Afghanistans hovedstad Kabul vil være etter at USA har trukket sine styrker ut av landet.
Morrison sier at Australias ambassade kan bli gjenåpnet når omstendighetene tillater det.