Den 31 år gamle mannen hadde tirsdag ettermiddag blitt bedt om forlate universitetsbiblioteket i byen på grunn av «forstyrrende atferd», skriver det tyske nyhetsbyrået DPA.
Etter det skal han ha blitt voldelig overfor en av de ansatte, skriver NTB.
Da politiet kom til stedet skal mannen ha holdt en machete, og politiet og påtalemyndigheten sier han kom med trusler mot politiet.
Det er ikke klart hvor mange skudd politiet avfyrte eller hvor på kroppen mannen ble truffet. Han ble kjørt til sykehus, der han døde av skadene.
Motivet for mannens truende atferd er ikke kjent, og DPA skriver at han ikke var kjent av politiet fra før.
NTB fremholder at 31-åringen var tysk statsborger, men opplyser ingenting om mannens etnisitet.