Det kommer fram i et presidentdekret som ble utstedt sent fredag kveld.
Istanbul-konvensjonen fra 2011 er en avtale som Europarådet sto i spissen for å utforme. Konvensjonen søker å bekjempe vold mot kvinner, inkludert vold i nære relasjoner, voldtekt i ekteskapet og kvinnelig kjønnslemlesting.
Avtalen ødelegger familiesamhold, oppfordrer til skilsmisse og henviser til likhetsprinsipper som brukes i LGBT-miljøet for å oppnå bredere aksept i samfunnet, hevder konservative i Tyrkia.
Opposisjonspartiet CHP kritiserer Erdogans beslutning.
– Å forlate avtalen betyr at man gjør kvinner til annenrangs borgere og lar dem bli drept, sier CHPs nestleder Gokce Gokcen.
Det har siden i fjor vært debatt i Tyrkia om en mulig uttredelse fra konvensjonen. Siden har kvinner demonstrert i gatene i Istanbul og andre byer i landet og oppfordret regjeringen til å holde fast ved avtalen.